首先，要注意种子消毒。在播种时，先用800倍50%氯溴异氰脲酸水溶液浸泡芫荽种子2-3小时，杀灭潜伏在芫荽种子内部的病毒，捞起洗净，沥干水分后再播种。这样，芫荽种子发芽后形成的幼苗就不容易感染花叶病毒病。
其次，要及时防治蚜虫。在芫荽幼苗开始展叶后，必须每7-10天叶面喷洒一次1500倍20%吡虫啉泡腾剂水溶液，或1000倍3%啶虫脒悬浮剂水溶液，或1500倍5%烯啶虫胺水分散剂水溶液，连续喷洒3-5次，均匀喷湿所有的叶片，以开始有水珠往下滴为宜，消灭吸附在芫荽叶片上为害的蚜虫，防止蚜虫传播病毒，就能减轻芫荽感染病毒病。
再次，要注意抑制病毒活性。在芫荽生长发育过程中，必须每15-20天叶面喷洒一次0.1%的硫酸锌、500倍5%宁南霉素混合液，或500倍5%病毒疫苗（菇类多糖）水溶液，或600倍菌毒克星水溶液，能明显抑制芫荽植株中的病毒活性，减轻芫荽花叶病毒病的发生和为害。
