1、发芽期 番茄的发芽期约需7~9天。在此期间可不必施用海藻菌肥，也可适量使用菌肥拌种，能提高发芽率和发芽质量。
2、幼苗期 分苗后，结合浇水，每7~10天追海藻菌肥一次，每次每亩用量0.5千克，共追2~3次。也可根外追施，用0.5%的菌肥上清液进行喷施，3~4次即可。
3、开花坐果期 此期营养生长与生殖生长矛盾特别突出，不必施肥。主要通过控制水分、划锄等措施调节生长与发育，营养生长与生长、地上部与地下部生长的关系，达到生长与发育均衡。
4、结果期 这是施用海藻菌肥的关键时期。从现蕾期开始，应及时追肥浇水。每7~10天浇一次水，保持土壤见干见湿。同时，将海藻微生物菌肥按1：200的比例加水稀释后随水冲施，直至拉秧。
