缺钙病始发于幼果，开始为水浸状暗褐色斑点，逐渐发展为褐色或黑色坏死区域。可以扩展至果实内部，病果提早变红，属典型的生理性病害，容易导致脐腐病。预防措施：以腐熟的有机肥做为底肥，并施用一定量的过磷酸钙，以防土壤缺钙。其次，要深耕土地，采用地膜覆盖栽培，保持土壤水分相对稳定，减少土壤中钙的流失。第三，结果期保证水分的均衡供应，严防忽干忽湿，高温干旱时及时浇水，雨季及时排水，确保根系的正常功能。第四，生长前期稳施氮肥，避免营养生长过旺，另外，在幼果期要及时摘除脐腐果，以减少植株体内的养分消耗，保证健康果实的生长。
缺钾
番茄生长需钾较多，缺钾时主叶脉之间的叶片组织褪绿，叶片卷曲、呈赤绿色，严重时沿叶缘发生灼伤。钾不足降低了果实中酸的含量，同时引起果实内部褪色。番茄生长中后期，即使土壤中钾的含量不低，但由于根系吸收能力下降，不能提供足够的钾素供给果实发育和植株生长，当果实成熟时仍表现出缺钾症状。当钾供应不足时，果实的发育就以损害叶片为代价，通常当结3穗～4穗果后，老叶易出现缺钾症状。栽培时应施足钾肥，钾肥易挥发，易淋失，应采取基施、追施以及叶面喷施相结合，以保证中后期钾素的供应。
缺磷
苗期磷素不足会使植株生长缓慢，叶片变紫。低温、干旱等原因也会阻碍了根系吸收能力，而出现缺磷症状。磷素在土壤中移动性较小，幼苗期需磷量大，应底施、深施。磷易被土壤胶体固定，所以施磷肥时可与腐熟好的有机肥混合施或开沟集中施，可采用颗粒状磷肥，使其减少与土壤的接触面，生长中后期可叶面喷施补磷，提高磷肥的利用率。
缺铁
铁属微量元素，但在植物生长发育中起着重要作用，铁不足可使叶片褪绿，碱性的土壤会阻碍植株对铁的吸收，应配施铁肥，但不宜过量。一般采用硫酸亚铁，底肥2千克／亩～7．5千克／亩，叶面喷施0．2％～1％的水溶液。
