西瓜果实畸形的原因：一是受精不良。据研究，西瓜果实内的种子能产生生长素，刺激果实的发育。瓜内种子发育好而多的部位，果肉发育也好；反之，果肉发育就差。如果开花时遇到低温、降雨，或传粉昆虫较少，受精不完全，很容易导致果实畸形。二是气候条件特别是温度条件不适宜。据研究，西瓜果实发育，前期以纵向生长为主，后期则依靠横向发育来完成一定的果形和大小。对于早熟栽培的西瓜，前期因外界气温低，纵向生长缓慢，而在果实生长后期，外界气温升高，横向生长相对加快，最后发育成了横径明显大于纵径的扁圆瓜。三是栽培管理不当。果实着地的一面由于晒不到阳光，瓜皮呈黄白色，瓜瓤发育也差，如不及时翻转，很容易出现畸形；果实发育前期遇到严重干旱，植株生长衰弱，果实膨大近于停止，而后期条件适合、特别是土壤条件适宜时，果实又继续发育，而且生长较快，在这种情况下，很容易形成一头小、一头大的葫芦形瓜。四是机械损伤。果实在生长发育过程中，遇到虫害或机械损伤，受损部位往往生长缓慢，也会使西瓜出现畸形。另外，在花芽分化时，进入子房中的钙素不足，也易发生畸形。
预防措施：①人工辅助授粉。人工授粉时，撒在柱头上的花粉一要均匀，二要充足，以保证授粉完全。②适当提高结瓜部位。据调查，西瓜第一雌花所结的果实，形多不正。为此，在生产上，一般选留距主根1米左右远处的主蔓上的第二、三雌花坐瓜。③幼瓜坐稳后及时垫瓜，将幼瓜下面的土整细拍平，做成一斜坡形高台，把幼瓜顺放在斜坡上。随着幼瓜的生长，斜坡逐渐加高加大。④及时翻瓜和竖瓜。在果实“定个”(即大小基本定型)后，每隔3～5天翻瓜一次，每次翻转1／3左右；在果实发育到七八成熟时，把瓜竖起来（称为“竖瓜”）。翻瓜和竖瓜可使果实发育圆正，皮色均匀，从而提高其商品价值。⑤及时浇水、施肥，以满足果实生长发育的需要。⑥及时防治病虫害，尽量减少机械损伤。对已形成的畸形瓜，要及早摘除，以促使植株再次坐瓜。
