在蓝耳病免疫接种时，免疫程序和疫苗的选择十分重要。选择疫苗时，种猪场和健康清净的阴性猪场应选用蓝耳病灭活疫苗，发病场或暴发过蓝耳病的猪场应选用蓝耳病弱毒疫苗；种猪用蓝耳病灭活疫苗，断奶仔猪和生长猪用蓝耳病弱毒疫苗。另外，弱毒疫苗只能用于保育猪和育肥猪，只有特别情况下用于种猪，仔猪在哺乳期一般不提倡用弱毒疫苗，免疫时要考虑与其它疫苗的间隔时间。弱毒疫苗免疫时要做好猪群的卫生管理和保健，灭活疫苗主要用于种猪群，首次应用该苗的猪场必须进行间隔3周的两次基础免疫，免疫时要足量免疫。
受蓝耳病威胁地区和猪场的疫苗免疫程序为：1、使用蓝耳病灭活疫苗对全群母猪和公猪进行免疫，基础免疫进行2次肌注，间隔3周，每次每头4毫升，以后每隔5个月免疫1次，每头4毫升；2、为4-10周龄猪肌肉接种弱毒疫苗1次，1头份/头；3、10-18周龄猪肌肉接种弱毒疫苗1次，2头份/头。暴发和流行蓝耳病的地区和猪场的疫苗免疫程序为：立即采取紧急预防接种策略，对3-18周龄猪进行弱毒疫苗免疫，3-10周龄猪肌肉接种弱毒疫苗2头份/头，10周龄以上的猪肌肉接种弱毒疫苗3头份/头，采用弱毒疫苗紧急预防接种时，可根据具体情况适当增加剂量。对于已经确诊为高热病的猪场，不能用抗菌素治疗，可以对有临床症状的猪用中药进行调理，有便秘的猪应及时通便，然后全部进行蓝耳病弱毒疫苗的倍量紧急预防接种，对于进食较少的猪可静脉注射葡萄糖和维生素C，对于有腹泻的猪可采用兽用双黄莲治疗。
