稻田施用丁草胺后，一般只有少量的药物被稻苗吸收，而且在水稻体内会迅速分解代谢，稻苗对丁草胺有较大的耐药力。但在用药量过大的情况下，会对水稻幼苗造成药害，出现生长受抑、根肿大等症状，严重的会导致死苗。一般认为，在移栽稻田和直播稻田使用丁草胺，60％丁草胺每亩用量不得超过150毫升，直播稻田用药后田面不能有积水，移栽田用药后水不能淹秧心。
在土壤偏旱的情况下，丁草胺的药效发挥会受到影响。张飞高反映去年当地有农民在旱直播田按每亩用50%丁草胺乳油300毫升的剂量施药后对直播稻没有造成药害，可能是用药后田间土壤持续偏干，药效发挥不充分。如果大面积生产上按这一剂量施用丁草胺，万一在施药后遇到大雨天气，丁草胺药效得以发挥，则很可能对水稻产生药害。去年，丹阳等地就有读者来电话反映，在直播稻田超量施用丁草胺后遇雨，水稻幼苗生长严重受抑，部分地段出现死苗等现象。直播稻播种季节紧，万一发生药害，补救的机动性很小，应尽可能避免药害发生。
有研究表明，由于稻田长期施用丁草胺，千金子、稗草等稻田恶性杂草已对丁草胺产生了较强的抗药性或耐药性，直播稻田单用丁草胺很难达到理想的杂草防除效果。特别是在千金子等杂草较多的田块，单用丁草胺后田间千金子仍可能大发生，以后不得不使用价格高的千金乳油等除草剂，反而会使防治成本增加。
在旱直播稻田，使用丁草胺与恶草酮的复配剂，或者施用丙草胺、施田补等除草剂，对千金子、稗草等杂草的防效更好些。
