炭疽病 又名黑点病、红点病、黑疤病等。炭疽病是危害线辣椒三大主要病害之首。主要危害线辣椒的果实，引起腐烂。该病分部很广，我省各个线辣椒栽种区都有不同程度发生，但因病源不同，可分为黑色多毛炭疽病和红色多毛炭疽病。
1、黑色多毛炭疽病 在果角上危害，常产生长圆形病斑，凹陷成水渍状物，有同心圆，到后期病斑上生出许许多多的小病斑，病叶病果上分生出孢子盘，病斑周围有一退色圈，干燥时病斑破裂，叶片受害产生褐绿色的水渍状斑点，形状不规则，以后病斑多为褐色，中央灰白，并有小黑点排列成轮纹状。
2、红色多毛炭疽病 主要危害辣椒的果实，老果易受害，果实上的病斑大体与黑色多毛炭疽病相似，但病斑上的黑点更大更黑，在潮湿情况下有小红点溢出。红色多毛炭疽病危害嫩果和老果，产生圆形或椭圆形的水渍状病斑，病斑黄褐色稍凹陷密生橙红色小点，潮湿时，表面溢出淡红色粘液，此病在高湿多雨时发病多，如8819、七寸红、冠秦19—1、冠秦19—3、丰力一号等易感染。尤其是接近成熟的果实易受害。排水不良，栽的过密，氮肥施用过多，都是致病的主要因素，本病的病菌常在上年遗留的植株残体上，在土壤中越冬。也可通过雨水、昆虫等媒介传播侵染。
防治炭疽病措施
1、选用抗病品种如981、冠19—1超长型等。
2、实行轮作倒茬且勿与茄科植物连作。
3、实行种子消毒，播种前，先将种子在清水中浸泡6—10小时，再用1%的硫酸铜溶液浸种5分钟，捞出洒上少量的草木灰综合酸性后再播种。
4、加强综合管理，当果实采收结束后，要迅速清园，把病株集中烧毁。增施磷钾肥，控制氮肥施用量，加强叶面喷肥，并采用500倍磷酸二氢钾可以增强植株抗性。
5、药剂防治。配制波尔多液，用硫酸铜0.5公斤、生石灰1公斤对水120公斤配制成天蓝色的波尔多液，连喷三次。用50%的百菌清600倍液。用50%或75%的甲托600倍液连喷三次效果很好。
花叶病毒病
线辣椒花叶病毒病在我省分布很广，各栽辣区都有不同程度的发生。其症状是叶片上着生黄绿色相同的花斑，易落果，幼叶狭窄，叶缘向上卷曲。深绿部分似疤向上突起，病株矮小，节间缩短，中上部小枝丛生，茎也丛生分枝，茎的小枝呈黑褐色条斑，重病部分枝和小枝或整个植株全部枯死。
线辣椒花叶病主要是由烟草花叶病和黄瓜花叶病侵染而发病，则产生轮圈状条斑，而黄瓜花叶病，主要产生花叶症状。而烟草花叶病主要由接触传播。如整枝打杈及其他农事操作。线辣椒花叶病主要由蚜虫传播病毒。在天气干燥情况下，大气温度在25—30℃，常有大量的有翅蚜活动，在辣椒叶背面产下人们肉眼看不到病毒性卵。病毒菌孢子就会引起花叶病毒病的发生侵染，它的传播速度很快，一夜之间就会扩大整个田块。如果同茄科作物连茬，更易感染花叶病毒病。
防治病毒花叶病措施
1、选择抗病优良品种：如981、西农二十。
2、在无病而生长健壮的植株上留种最好，选用中上层果角。
3、实行轮作倒茬，不能与茄科作物连作。
4、采用早育苗，培育壮苗，早定植，早发棵。
5、加强土壤精耕细作，保证植株生长强壮。
6、如有蚜虫用40%的乐果1500倍液或70%的甲级托布津1500倍液连喷3—4次。
7、用20ppm荼乙酸在发病前喷两次。
枯萎病
此病主要危害对象是线辣椒根茎，发生部分呈褐色，腐烂，发软，易用手指剥落，全株枯萎，此病多发生在八月高温多雨季节，或大水猛灌又遇降大雨或浇水后部分积水地块。
防治枯萎病措施
1、深翻土地，精细整地，地面要平整，精细整枝，及时排涝。
2、多中耕，保证土壤疏松，根系发育旺盛。
3、结合中耕，破头期进行倒行，促根系发达。
4、合理轮作倒茬勿与茄科作物连作。
5、浇水要看天看地看秧苗，如果地面裂口，秧苗生长缓慢，确需浇水，但根据天气预报三天无雨再浇水。
6、增施磷钾肥，氮磷钾三要素也需配合得当。
