鸡爪菌属于竞争性杂菌，是一种蕈状芽孢杆菌寄生鸡腿蘑菌丝体上，与鸡腿蘑菌丝争夺营养，然后转入生殖生长，产出形状似鸡爪的子实体。鸡爪菌的菌丝初期灰白色，后形成索状向料层伸展，然后爬上料面产生原基长于土层表面。鸡爪菌子实体初期为浅褐色或棕红色，内部白色木质化，闻有异味。
鸡爪菌原生于土壤腐殖层，子实体成熟后散发担孢子，通过空气、土壤、水、堆肥以及昆虫等传播。在温度20-30℃时容易发作，夏秋季节孢子大量萌发，传播很快。鸡腿蘑前期菌丝生长阶段发生鸡爪菌侵袭时，养分受到破坏，影响正常生长；后期随着鸡爪菌的菌丝蔓延，分泌出一种有害的胞外酶，蚀袭鸡腿蘑菌丝，使菌丝逐步萎缩，无法转入生殖生长，以致不出菇。防治鸡爪菌的措施如下：
一、优化场地，堵绝病原菌。栽培场地土壤、杂草、垃圾等是鸡爪菌繁殖的地方。要杜绝污染源就要做到“三强调”。
①强调水旱轮作，1年种农作物，1年种菇；
②强调环境卫生，提前清除周围杂草垃圾与废料；
③强调消毒灭菌，场地翻土晒白，用石灰水喷洒消毒。
二、科学配料，杀灭潜存有害菌。鸡腿蘑是用棉籽壳、玉米芯、蔗渣等作为原料，而这些原料中往往附着有害菌孢子。要根绝就得做到“三必须”。
①必须选料曝晒，选择无霉烂变质的原料，并曝晒1-2天，利用阳光紫外线杀灭有害菌孢子；
②必须配方合理，掌握原料（棉籽壳或玉米芯等）占85%，麦麸10%，石灰粉3%，石膏粉1%，复合肥1%，加水110%，pH7-8；
③必须堆料发酵，发酵是杀灭鸡爪菌的有效手段，将原料加水拌匀后，堆集发酵2-3天。当料温上升至65℃后翻堆3-4次，达到料色棕褐，呈现大量放线菌菌丝及孢子，有香味，pH7.5为宜。
三、育好母体，以强制弱。为根绝鸡爪菌，采取育好母体以强制弱，为此严格执行“四要求”。
①料袋灭菌要求100℃后持续4-6小时；
②接种要求无菌操作，防止“病从口入”；
③培养室要求事前消毒杀菌，可用气雾消毒盒或硫磺熏烟消毒；
④培养室要求温度23-25℃，不超过28℃，室内干燥，避光，注意通风，抑制病菌发作。
四、讲究覆土，强化消毒。鸡腿蘑不覆土就不出菇，但土壤中病源菌较多，为此必须“四注意”。
①注意选土，选择没发生过鸡爪菌的土壤作为覆土材料；
②注意消毒，覆土材料曝晒2-3天后，再用2%石灰粉拌匀消毒；
③注意灭菌，将覆土材料集堆后打入蒸气，土温上升到65℃时保持1-2天，然后打散排除废气；
④注意土质含水量，覆土含水量不超25%。
五、出菇管理，营造环境。鸡腿蘑出菇阶段也是鸡爪菌子实体发作时期，为此必须采取“五控制”。
①控制水源污染，长菇期喷水禁用池塘水、沟水等污染水质；喷水增湿空间相对湿度不超过95%，以防有害菌孳生；
②控制光照度，菇棚光线以500-1000勒克斯散射光为宜；
③控制有害气体，长菇期加强通风，保持菇棚空气流畅；
④控制与有害菌混生，一旦发现鸡爪菌迹象，立即把菌丝连同培养料一起挖出，远离菇房处理，并在患处撒上石灰粉，防止蔓延，或采用“鸡爪菌立灭王”药剂杀灭。
⑤控制成熟期，覆土后10-15天菇蕾大量发生，菌柄抽长、菌盖饱满时即可采收，防止过熟霉烂引起鸡爪菌侵蚀。
