蜜橘风味独特，汁多味甜，多数品种售价比其他柑橘高，不过由于其皮薄易损伤等原因，储藏有其独特之处，果农应当留心。
一、红橘地沟储藏：选一未耕种过、地势平坦、排水好、属冲积或紫色土的地方挖个露天土沟，要求断面呈倒梯形，上宽90-100厘米、底宽30-40厘米，待沟内三面土自然风干呈白色时，用800毫克/公斤的多菌灵和1000毫克/公斤的托布津溶液喷洒地沟消毒，然后在沟内铺垫一层经福尔马林密闭熏蒸消毒的稻草。地沟储藏的红橘宜在八成熟时采收，采后当天用200毫克/公斤的2，4-D加500-800毫克/公斤的多菌灵浸泡30秒，取出自然晾至果失重3%时入沟散堆储藏。果在沟内中部堆高35-45厘米，沟四周堆高30厘米，最后在堆上面再盖一层10-15厘米厚的已消毒的稻草。此法可储藏60-70天，腐烂率5%以下。
二、红橘松针储藏：选一通风、干燥、凉爽房屋的一角，打扫干净后墙壁及地面撒上石灰粉消毒。果实采后当天用200毫克/公斤的2，4-D加500毫克/公斤的多菌灵溶液浸洗果30秒后，取出放阴凉通风处晾3-4天并使果失重2-3%，接着先在地面铺一层6-7厘米厚的鲜松针，然后在松针上放一层果，果面再铺一层厚3-4厘米的松针，如此堆放4-5层。此法中松针的用量为果实的7-10倍，要求每层不露果实。本法可储果90-100天，好果率85-95%。
三、南丰蜜橘中草药防腐保鲜储藏：先用高粱姜、艾叶、野菊花按1:1:15熬煮，然后将原液稀释15倍浸洗当天采收的果实，取出晾3-4天后放低温库储藏。此法储藏果实80-90天，腐果率仅9%。
四、蜜橘塑膜袋单果包装储藏：此法适用于红橘等果型较大的品种。采果当天用多菌灵250-500毫克/公斤或抑霉唑500毫克/公斤，或托布津500-800毫克/公斤加2，4-D100-200毫克/公斤的溶液浸洗果20-30秒，然后将果装入竹筐等容器内放阴凉通风处发汗3-5天，使果实失重3-4%，再用厚0.01毫米厚聚乙烯薄膜保鲜袋进行单果包装。如是南丰蜜橘等小果品种，则应将发汗后的果装入内垫大保鲜薄膜袋的塑料或竹箱内。果实单果包装并装箱后，可储藏于打扫干净并消毒的普通房内。储藏期间要尽量将温度控制在4-20℃、相对空气湿度80-85%。此法可储藏果实3-4个月。
五、蜜橘塑膜大帐储藏：将当天采的果用橘腐净100倍液浸洗果1分钟，取出后放阴凉通风处发汗3-5天，再将果实装入已消毒的塑料或内垫消毒纸屑的竹筐等容器中。装果箱要码在打扫干净并消毒的房内；果箱一般摆放4-5层，最上层果箱的表面要垫上消毒的草纸，接着在其上套盖厚0.06毫米的聚乙烯薄膜大帐。储藏期间每隔6-7天揭开大帐换气1次。此法可储藏蜜橘至春节。
