一、真菌性病害
常见瓜类种传真菌性病害有：黄瓜疫病、黄瓜炭疽病、西瓜炭疽病、甜瓜炭疽病、黄瓜枯萎病、黄瓜蔓枯病、黄瓜黑星病、南瓜白绢病和冬瓜白绢病。这些病害多数都以菌丝体潜伏于种子内，也有以分生孢子或菌核附着种子外表。以上病害的种子消毒方法如下：
1.温汤浸种：
将种子放在55℃温水中，浸泡15分钟，然后用冷水冷却，催芽后播种。
2.药剂浸种：
（1）福尔马林浸种，用40％福尔马林100倍液浸种30分钟，浸后用清水洗净，然后播种或晾干备用。
（2）多菌灵或普力克浸种，用50％多菌灵500倍液浸种1小时，或用72.2％普力克水剂800倍液浸种0.5小时。
（3）代森铵浸种，用50％代森铵500倍溶液浸种1小时。
（4）咪唑盐酸浸种，用咪唑盐酸500倍液浸种1～2小时。
（5）漂白粉浸种，防治黄瓜枯萎病，可将种子放在2％～3％漂白粉溶液中浸泡30～60分钟，浸过的种子用水洗净后晾干播种。
3.药剂拌种：
防治黄瓜疫病可用50％福美双可湿性粉剂，按种子重量的0.4％的药量拌种；也可用绿亨2号可湿性粉剂拌种，每公斤种子用药量为4～5克，可有效地防治潜伏于种子上的真菌性病害。
二、细菌性病害
黄瓜常见的细菌性病害是细菌性角斑病，其消毒方法主要为温汤浸种和药剂浸种处理。温汤浸种处理方法与黄瓜炭疽病等真菌性病害的处理方法相同。药剂浸种处理，可用150倍的40％福尔马林浸种1～5小时，然后用清水充分洗净，晾干播种；也可用100万单位的硫酸链霉素500倍液浸种2小时，冲洗干净后催芽播种。
三、病毒病
1.温汤浸种：对黄瓜花叶病，可将种子放在60℃～62℃的热水中浸10分钟或在55℃热水中浸40分钟，然后立即投入冷水中冷却，晾干后播种，有较好的防效。
2.药剂浸种：西瓜、葫芦等瓜类种子所带的绿斑花叶病毒，可用10％磷酸三钠浸种20分钟，用清水洗净后播种。
