（1）芹菜的假植贮藏
芹菜的假植贮藏方法各地不尽相同，冬季不很寒冷的地区多用用深沟假植法。一般沟宽与深均为0.7～1.5m，长度不限，将修整好的芹菜假植于沟内。华北、西北大多数地区采用普通最畦假植。近年天津等地采用高约1.2～1.4m，宽3m的长形塑料薄膜拱棚。假植贮藏效果好，在寒冷的东北地区可得用温室或立壕进行假植贮藏。
入藏的芹菜要选用实杆类型，如天津的白高芹菜；陕西的实杆绿芹；以及北京的棒儿芹、大糙皮者是丰产耐藏的品质。
入藏时一般是将预处理的芹菜成捆假植于沟、棚或温室内，捆间留有一定空隙，以利通风，此法贮量大。还有采取单株或双株假植的，此法贮量小但贮期长。假植后立即浇水，水量要足，以确保整个贮期有充足的水分。
芹菜喜冷凉，贮温应控制在1～1.5℃范围内，前期温度高，应加强通风以降温。后期主要是防冻，随温度下降夜间应逐渐盖严，白天适当通风，寒冷季节更要加强防寒，以防芹菜受冻。
（2）芹菜的冻藏
冬季不太寒冷地区，常在风障北侧建地上式冻藏窖，窖的四周用夹板填土打实，厚0.5～0.7m，高约1m左右，窖底挖若干通风沟，通风沟的一端与南墙正中上下方向的通风筒相通，另一端穿过窖底在北墙外向上开口，形成一个完整的通风系统。
窖底铺秫秸和细土，把芹菜捆成5～10Kg的捆，根向下斜放窖内，装满后在芹菜上覆一层细土，使叶子似露末露，初期白天盖草帘，夜间揭开，以防窖内温度过高。随着天气转冷，分次覆土，总厚度为20～30cm。严冬季节堵塞北边的通风口，使窖内温度保持在-1～2℃使菜叶上呈现白霜，叶柄及根系不受冻害为宜。
芹菜的解冻方法与菠菜相似，可取出芹菜放在0～2℃的条件下缓慢解冻，恢复新鲜后上市。也可以在出窖前5～6天拔出防风障，改设在北面。瑞在窖面上扣上薄膜，芹菜化冻一层铲除一层，最后留一层薄土，使窖内芹菜缓慢解冻，这种方法损耗小。各地可根据当地气候条件灵活掌握。
（3）芹菜的窖藏
选择地势高燥，背风向阳的地方挖东西向菜窖，一般长3.3m，宽1.3m，深度应超过所贮芹菜15cm左右。窖壁四周镶两圈棍棒隔潮，防止芹菜挨窖壁发生霉烂。
下霜前，将地里芹菜移入窖内。移栽前一天，菜畦要浇足水，第二天成墩掘下（尽量少伤根），随即栽入窖内，一墩墩靠紧，空隙的地方撒湿土按实。待窖满后，立即浇足水，天黑前盖上草苫或再加一层塑料薄膜。
刚入窖时，因气温较高，早晨可揭开草苫，天黑前再盖好。如窖内土壤缺水，可趁晴好天气再浇一两次透水，始终保持湿润。天气转冷以后，一般应在10～16时揭开昌苫晾晒窖菜。如遇大风，雨雪天气，则不揭草苫，以防冻害但最长3～4天也要抢时间晾晒一次，防止闷菜为黄。
（4）芹菜的塑料袋贮藏
将叶根鲜绿、生长健壮、无病虫害的实心或半实心芹菜，带3cm左右长的短根，经挑选整理后，捆成1~1.5Kg的把，在冷库内-2~2℃温度下预冷1~2天。然后采用根里叶外的装法装袋（袋是用0.08mm厚的聚乙烯塑料薄膜，制成75cm*100cm的袋），每袋装12.5Kg，然后扎紧袋口，分层摆在冷库的菜架上，库温在0~2℃保持袋内氧含量不低于2%，二氧化碳含量不高于5%。气体组分不符合要求时，可打开袋口，通风换气后再扎紧袋口，贮藏期间可视情况检查1~2次。注意防止袋子被扎破漏气，如有已漏气的袋子要及时更换。
