无论是哪一种微生物实验室，只要操作感染性物质，气溶胶的产生是不可避免的。因此，除了控制空气传播感染，还要防止气溶胶扩散，这是控制空气传播感染的第二环节。在实验室中，有多种措施可以有效防止气溶胶的扩散，例如“围场操作”、“屏障隔开”、“有效拦截”、“定向气流”、“空气消毒”等，这些防护措施的综合利用可以获得良好的效果。
(1)围场操作：围场操作是把感染性物质局限在一个尽可能小的空间(例如生物安全柜)内进行操作，使之不与人体直接接触，并与开放之空气隔离，避免人的暴露。实验室也是围场，是第二道防线，可起到“双重保护”作用。围场大小要适宜，以达到既保证安全又经济合理的目的。目前，进行围场操作的设施设备往往组合应用了机械、气幕、负压等多种防护原理。
(2)屏障隔离：气溶胶一旦产生并突破围场，要靠各种屏障防止其扩散，因此也可以视为第二层围场。例如，生物安全实验室围护结构及其缓冲室或通道，能防止气溶胶进一步扩散，保护环境和公众健康。例如，BSL-3实验室核心区和半污染区之间的缓冲间则把操作感染性材料的核心区围场在尽可能小的范围内。按国家标准《实验室生物安全通用要求》(GBl9489-2004)的要求，进出核心实验室的缓冲间是必需的设置。这是因为：
1)避免污染扩散，尽可能把污染限制在最小的范围内；
2)一旦室内出现正压，工作人员可在缓冲室内换气、净化空气、安全撤离；
3)退出实验室时可在其内换鞋、脱去外层衣服和手套、必要的消毒，避免内
层衣服污染或污染其他房间。
(3)定向气流：对生物安全三级以上实验室的要求是保持定向气流。其要求包括：
1)实验室周围的空气应向实验室内流动?以杜绝污染空气向外扩散的可能，保证不危及公众；
2)在实验室内部，清洁区的空气应向操作区流动，保证没有逆流，以减少工作人员暴露的机会；
3)轻污染区的空气应向污染严重的区域流动。
以BSL-3实验室为例，原则上半污染区与外界气压相比应为一20Pa，核心实验室气压与半污染区相比也应为一20Pa，感染动物房和解剖室的气压应低于普通BSL-3实验室核心区。
(4)有效消毒灭菌：实验室生物安全的各个环节都少不了消毒技术的应用，实验室的消毒主要包括空气、表面、仪器、废物、废水等的消毒灭菌。在应用中应注意根据生物因子的特性和消毒对象进行有针对性的选择。并应注意环境条件对消毒效果的影响。凡此种种，都应在操作规程中有详细规定。
(5)有效拦截：是指生物安全实验室内的空气在排人大气之前，必须通过高效粒子空气(HEPA)过滤器过滤，将其中感染性颗粒阻拦在滤材上。这种方法简单、有效、经济实用。HEPA滤器的滤材是多层、网格交错排列的，因此其拦截感染性气溶胶颗粒的原理在于：
1)过筛：直径小于滤材网眼的颗粒可能通过，大于的被拦截；
2)沉降：对于直径0．3／zm以上的气溶胶粒子作用较强。气溶胶粒子直径虽然小于网眼，由于粒子的重力和热沉降或静电沉降作用也可能被阻拦在滤材上；
3)惯性撞击：气溶胶粒子直径虽然小于网眼，由于粒子的惯性撞击作用也可能阻拦在滤材上；
4)粒子扩散：对于直径小于o．1Um的气溶胶粒子作用较强，气溶胶粒子虽然小于网眼，由于粒子的扩散作用也可能被阻拦在滤材上。
依照上述原理，最不容易滤除的粒子是0．1～0．3／zm的粒子。
防止气溶胶的吸入
尽管采取了上述防止气溶胶扩散的种种措施，但由于气溶胶具有很强的扩散能力，还是不可避免地污染实验室的空气。所以，实验室工作人员仍然需要进行个人防护，以防止气溶胶吸人。
