论文写作不但开始于思考创新性idea，而且贯穿于整个实验过程、论文写作和发表的全过程。在前文已经提到，在思考创新性idea过程中，应该已经勾勒出论文的大致框架，在实验过程中，就是也将此框架进一步细化的过程，一旦有了新的实验结果出来，很多人（尤其日理万机的临床医生们）就是简单地将数据放在一边，而没有及时整理，这样做的后果至少有两个：
1）时间久了，到写论文时，你自己都忘了怎么回事；
2）不能及时发现实验结果的问题或出乎意料的新的发现，也就不能进一步采取相应的措施。
我自己的经验是：
a）做实验前，尤其是新实验（哪怕是实验室其他人已经做了N遍的实验）先尽可能的写清楚实验步骤（protocol），这个protocol最好用英文写，并且做成电子版，存在自己的电脑中，打印一份贴在自己的笔记本中，以后再用该protocol，只需写明：参见xx页（refer Pxx。这样到时候写论文时，就很方便了；
b）新的实验结果一旦得到，要将数据尽快整理成图表，用Powerpoint做成PPT格式，质量和格式就和准备发表一样，哪怕是阴性结果，并且将实验的相关信息和参数尽量详细列出，这样以后无论是开会做presentation还是撰写论文都会方便很多；
c）如果是阴性结果，和预测的不同，分析问题的可能原因，有无别的替代方法？是否要修改原来实验方案乃至整个实验设计？
d）同样重要的是，在实验过程中，要经常（我一般一周至少一次）查Pubmed（生物医学最著名的、最重要的摘要数据库），看相关领域是否有新的论文发表，如果相同思路的结果已经发表，就要及时调整实验方向。
当然，看到好的相关相关文献要及时加到Endnote等文献管理软件中。另外，这一过程也是熟悉本领域最新发展的过程，届时写论文时就会有胸中有丘壑的感觉，写起来就可以得心应手。
采用上述几个措施，写英文论文应是一件不难的事情（只要英语不是很差），著名博主施一公曾经撰文说，他最快的记录是，傍晚开始，一个通宵搞定一篇论文（当然他的文章决不是豆腐块式的垃圾论文），我这样的无名小卒，自然不能和施相提并论，我一般不会停下实验全时写论文（连续写太长时间，眼睛太累），在做实验的间隙写，因为在写之前，由于平时的积累，数据、图表和文献等都基本准备齐全，所以一般最长一个星期之内即可完成第一稿。
我曾看到有站友说写一篇文章花了几个月甚至大半年。虽然是“慢工出细活”，但是太慢了，很难出“细活”（尤其是写论文这活）。对于撰写论文而言，反而是强调趁热打铁，一方面是由于发表时效的问题，尽快发表，才能避免上述的问题；另一方面，时间战线拉的太长，你前面自己写的东西都已经忘记了，最终反而要花更多的时间来写，所以，写文章最好还是一气呵成。即使不能“一气”，也别“N气”，因为：“一鼓作气，再而衰，三而竭”。
所以在做实验的过程中，也同样可以在两方面准备你的论文手稿：
1）及时整理数据；
2）跟踪、更新、阅读相关文献。
两手都要抓，两手都要硬！
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