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资金预算
资金投入和软件功能及服务情况基本呈正比，只有明确资金状况的情况下才能更清醒的限定系统功能，否则很有可能导致竹篮打水一场空。
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明确实施LIMS的目的
明确实施LIMS的目的，是真正能够正确采购及合理实施的前提。任何软件系统都不是万能的，LIMS也同样，真正的LIMS的意义在于规范检测机构管理，提高管理水平。所以应该把LIMS看作是一个长期提高管理水平的工具，并不一定马上看到工作量的减轻。
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实验室的核心工作和核心职能是什么
每个检测机构必有它的核心工作和核心职能，这也是LIMS最关心的，真正好的LIMS系统是关心核心工作和核心职能的系统。很多检测机构在选择LIMS时大都很看重参考计算机中心的意见，而大多数计算机中心人员往往看重系统和仪器的连接或是与硬件的匹配程度，甚至是开发技术或界面风格是否符合个人喜好的问题。往往导致LIMS选购舍本逐末。
因此，就目前LIMS市场状况，在选择时应考虑以下几点：
纵观当前LIMS市场，我们可以简单地把LIMS系统划分为三类：
第一类是小型LIMS系统，使用传统开发工具，一般为单机版或C/S结构，其缺点是，无平台升级成本高，功能相对简单，稳定性不强。
第二类是普通型LIMS系统，使用关系型数据库，一般为C/S结构，包含了检测流程、报告管理、资源管理及相应的安全设置，是国内主流的LIMS产品，国内外各主要LIMS供应商都提供此类型LIMS软件，基本占到国内LIMS软件的80%以上的市场。
第三类是LIMS解决方案，基于应用服务器平台和关系数据库开发的应用系统，除了传统意义上的LIMS以外，还包含，质量追溯、客户抱怨、质控管理等与质量管理相关的功能，并且如果客户需要提供包括实验室整体建设、管理培训等软性服务。
这类系统的优点是和其他系统的接口相对容易，由于使用了关系数据库系统，处理巨量数据时性能有大幅度提高，已经对原有市场上的主要产品就会形成比较大的压力。
选择LIMS系统，不能仅仅着眼技术，需要考虑多方因素，还应该看公司实力、产品功能对需求的满足程度、实施能力和价格等因素。
首先，明确自己的需求。如果没有明确的需求，就会被产品供应商牵着鼻子走。很多时候，用户在选择软件的时候，由于没有清晰的需求，导致选型的过程变成了软件测评博览会。有了明确的需求，就可以根据自己需求、产品的功能，及二者的符合程度来选择合适的产品。
其次，考察LIMS厂商的诚意和实力。没有诚意的LIMS厂商，不会重视你。而仅有诚意是不够的，如果LIMS厂商没有相当的资金实力和技术实力，也无法最终有效解决问题。如果供应商中有检测背景的专家就再好不过了。
第三，考察技术架构，灵活性和开放性不好的技术架构会让企业付出代价。因为企业的内部流程不会是一成不变的，因此LIMS系统也会经常调整。如果LIMS系统的架构不好，降低了系统的柔性，就会在系统接口、可配置性、内部集成性上留下隐患，导致系统封闭和僵硬，不能适应变化。特别是企业内部都有一定量的信息系统在运行，LIMS系统和现有系统集成和兼容问题，也是LIMS选型中需要注意的一个因素。
第四，看项目团队和实施方法。LIMS是一个企业应用软件，实施过程不是简单的软件安装，还有繁琐的设置和大量的培训工作。没有好的实施项目团队，会导致项目失败。如果实施过程没有保障的话，也是不能够令人放心的.
最后，要选择性价比合适的产品。
