首先要清楚检测哪类微生物：
1、根据病原菌的致病部位：肠道致病菌、呼吸道致病菌等。
2、何类产品的微生物：食品中微生物、化妆品中微生物、水质中微生物等。
二、审核盲样性状：
根据盲样性状制订检测方案，如：液体、固体、附着于载体上、产品(食品、化妆品、水等)。
混合菌(一般为1~3株菌，不同种类，它们之间为不同比例)还是单一菌？
三、制订检测要点：
1、涂片染色、镜检：
1）、判定染色反应：革兰氏染色、抗酸染色、芽胞染色、鞭毛染色等。
2）、菌体形态：球菌（分散状、成堆状、链状、成双状）、杆菌：（长杆菌、短杆菌、粗杆菌、细杆菌、链杆菌、弯曲杆菌等）。
2、培养：
1）、根据作业指导书，选择分离培养用培养基及增菌培养用培养基，从增菌培养管中挑取增菌液，进行增菌及分离培养。
2）、根据盲样检测目标、盲样性状、染色镜检等信息，选择分离培养用培养基及增菌培养用培养基，进行增菌及分离培养。
3、挑取可疑菌落进行纯培养：
参照从染色镜检的信息、选择菌落等，从培养基上选择不同菌落形态、色泽、光滑、湿润程度、边缘状态等。进行纯培养。
4、生物化学试验：
根据菌落特点、染色镜检等信息，选择生物化学反应试验。
如：可疑为肠道致病菌，选择三糖铁培养基进行初筛，然后进行全面生物化学试验等。
可疑为金黄色葡萄球菌，进行血浆凝固酶试验等。
5、血清学试验：
根据菌落形态、染色镜检、生物化学试验等，选择诊断血清分群、分型。
四、综合分析：
根据菌落形态、染色镜检、血清学试验、生化试验或分子生物学检测等，判定盲样中微生物的种类名称。
